Repeat Type | Repeat Motif | Number of Repeat Units | Total | Analysis | ||||||||||||
4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | >20 | ||||
Mononucleotide | A/T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 211 | 211 | 214 (54%) |
G/C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3 | 3 | ||
214 | ||||||||||||||||
Dinucleotide | AG/CT | - | - | - | - | - | - | 6 | 4 | 4 | 1 | 4 | 2 | 14 | 35 | 106 (27%) |
AT/AT | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | 13 | 20 | ||
AC/GT | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | - | 1 | ||
TA/TA | - | - | - | - | - | - | 3 | 3 | 1 | - | 1 | 2 | 7 | 17 | ||
GA/TC | - | - | - | - | - | - | 4 | 7 | 5 | 4 | - | 3 | 10 | 33 | ||
13 | 15 | 12 | 7 | 6 | 9 | 44 | ||||||||||
Trinucleotide | AAC/GTT | - | - | - | 1 | - | - | - | - | 1 | - | - | - | - | 2 | 45 (11.5%) |
AAT/ATT | - | - | - | 1 | 1 | - | - | - | 1 | - | - | - | - | 3 | ||
ACC/GGT | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
AGA/TCT | - | - | - | 4 | - | 3 | 1 | 3 | - | 1 | - | - | - | 12 | ||
AGC/GCT | - | - | - | 2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | ||
ATA/TAT | - | - | - | 1 | 2 | - | 1 | 1 | - | - | - | - | - | 5 | ||
ATG/CAT | - | - | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
CAC/GTG | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
CAG/CTG | - | - | - | 1 | - | 1 | - | 1 | - | - | - | - | - | 3 | ||
CTT/AAG | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
GAA/TTC | - | - | - | 2 | 1 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | 4 | ||
GCA/TGC | - | - | - | 1 | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | ||
GGA/TCC | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TAA/TTA | - | - | - | 1 | - | 2 | 1 | 2 | - | - | - | - | - | 6 | ||
TTG/CAA | - | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
19 | 5 | 8 | 3 | 7 | 2 | 1 | ||||||||||
Tetranucleotide | AAGA/TCTT | - | 2 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 9 (2%) |
AATT/AATT | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
CATA/TATG | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TATT/AATA | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TTAA/TTAA | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TTAT/ATAA | - | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TTCT/AGAA | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TTTA/TAAA | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
8 | 1 | |||||||||||||||
Pentanucleotide | AAGAA/TTCTT | - | 1 | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 11 (3%) |
AGGAA/TTCCT | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
ATTTT/AAAAT | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | |||
CTTCT/AGAAG | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TAAAA/TTTTA | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TATTT/AAATA | 1 | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | ||
TCTTT/AAAGA | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TTATA/TATAA | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TTTCT/AGAAA | - | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
5 | 4 | 1 | 1 | |||||||||||||
Hexanucleotide | AAAAAG/CTTTTT | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 10 (2.5%) |
CAGCTC/GAGCTG | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
GCTGGT/ACCAGC | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
GGATCA/TGATCC | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
GTTTCA/TGAAAC | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TTCCAT/ATGGAA | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TTTATT/AATAAA | 1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | ||
TTTCTC/GAGAAA | 3 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3 | ||
10 | ||||||||||||||||
Total | 395 |